Ve Far Cry 3 se ocitnete v kůži Jasona Brodyho, muže osamoceně stojícího na okraji světa na tajemném tropickém ostrově odříznutém od civilizace. V tomto brutálním ráji, kde zločin a násilí představují jediné jistoty, budete rozhodovat, kdy a jakým způsobem se budou události hry vyvíjet.
Za hranicemi civilizace se rozkládá ostrov, kde neplatí žádné zákony. Je to místo, kterému vévodí pirátství a lidská bída, a odkud je úniku pouze skrze drogy nebo kulku do hlavy. A přesně tady se ocitáte. Zůstali jste trčet tam, kde se nerozlišuje dobro od zla, na místě, které se řídí principy násilí.